Strukturelt har polyorganosiloksaner følgende egenskaper:
(1) Hovedkjeden Si-O-Si-bindinger er uorganiske, mens sidekjedene er organiske grupper, noe som gjør dem til en typisk semi-uorganisk, semi-organisk polymer.
(2) Bindingsvinkelen (∠SiOSi) til Si-O-Si-bindingene i hovedkjeden er 130 grader –145 grader, bindingslengden til Si-O-bindingene er 0,163 nm–0,164 nm, og bindingsenergien er 367 kJ/mol. Sammenlignet med karbonoksider i samme gruppe (bindingsvinkel ∠COC 108 grader, C-O-bindingslengde 0,142 nm, bindingsenergi 357,4 kJ/mol), har polysiloksaner en stor bindingsvinkel, lang bindingslengde og høy bindingsenergi i hovedkjeden.
(3) C-Si-O-bindingsvinkelen i sidekjeden er 160 grader, og C-Si-bindingslengden er 0,188 nm. Derfor er aktiveringsenergien som kreves for at metylgruppen i sidekjeden skal rotere rundt Si-O-bindingen lav, bare 8 kJ/mol.
(4) Dipol-dipolinteraksjonene mellom Si-O-bindingene i polysiloksan-ryggraden og interaksjonene mellom Si-CH3-gruppene i sidekjedene fører til at polysiloksanmolekylet eksisterer i en viss -spiralstruktur med metylgruppen vendt utover{6}} mot silikonbindingen.{6}} Denne unike strukturen resulterer i svake inter-kjedeinteraksjoner, et stort molarvolum og lav overflatespenning i polysiloksaner.
(5) Polysiloksaner med Si-H-, Si-OR- eller Si-OH-grupper som sidegrupper er alle reaktive.